做生物信息学分析，求 Python 和 R 教程

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V2EX 提问指南

这是一个创建于 3128 天前的主题，其中的信息可能已经有所发展或是发生改变。

因工作中需要许多 dry lab 的数据分析，因此需要自学 Python 和 R 教程，用于生物大数据分析和文章发表。
求易于上手的教程或者 textbook 。
谢谢

8 条回复 • 2016-05-21 00:09:44 +08:00

lbp0200

2016-05-20 11:07:50 +08:00 via Android

慕课网有视频

DaPanda

2016-05-20 11:14:29 +08:00

可以看看 [Python for Informatics]( http://www.pythonlearn.com/book.php) ，专门为以信息处理为目的的 Python 入门教材，很实用。

yech1990

2016-05-20 13:20:54 +08:00

生物有毛线大数据, 不要跟风

Geeker

2016-05-20 13:29:42 +08:00

《集体智慧编程》
《 R 语言实战》

endosome

2016-05-20 20:25:53 +08:00 via iPhone

@yech1990 几千万甚至上亿的序列，手工没法完成吧。实际需要，不是跟风

yech1990

2016-05-20 23:18:02 +08:00 via Android

@endosome 这也就是几百 M 的 reads 。
分分钟的事，不要扯什么大数据

endosome

2016-05-21 00:07:52 +08:00

@yech1990 咱乡下作坊没有见识过大数据，见过的最大世面就是一个样品做出来几千万几亿的序列。
以前几百个序列还可以手工操作；对于上亿的序列，我觉得需要写一点 script ，才能完成既定的分析任务。
在我和我的同事眼里，这就是大数据， big data

endosome

2016-05-21 00:09:44 +08:00

@DaPanda looks cool. Appreciate it.