请教问题： Linux 下的 fd 数目限制

最近遇到一个奇怪的问题：
在命令行中手工启动某个程序，检查 /proc/xxxx/fd 目录， 能查到 1236 个 socket 句柄。
如果在 rc.local 中启动启动同样一个程序，检查 /proc/xxxx/fd 目录，只能查到 1024 个 socket 句柄。

用 ulimit -a 检查了 root 用户和当前用户的配置，都已经设置成了 65535.
root@Debian:/proc/3784/fd# ulimit -a
core file size (blocks, -c) 0
data seg size (kbytes, -d) unlimited
scheduling priority (-e) 0
file size (blocks, -f) unlimited
pending signals (-i) 16124
max locked memory (kbytes, -l) 64
max memory size (kbytes, -m) unlimited
open files (-n) 65535
pipe size (512 bytes, -p) 8
POSIX message queues (bytes, -q) 819200
real-time priority (-r) 0
stack size (kbytes, -s) 8192
cpu time (seconds, -t) unlimited
max user processes (-u) 16124
virtual memory (kbytes, -v) unlimited
file locks (-x) unlimited


这是什么情况呢？ 有 v 友遇到过类似的问题吗？ 似乎 rc.local 启动程序，使用了不同的资源限制？ 系统是 Debian 7。

谢谢！