Homebrew 自带安装的包裹？以及与 R 和 Textlive 等兼容问题。

autoconf libksba libyaml openssl readline
automake libgpg-error libtool pkg-config

1、这几个在/usr/local/Cellar下的文件夹我不记得有装过，请问是不是Homebrew自带的？

2、还有我在运行brew doctor时候碰到许多警告。对Homebrew居然不自行建一个文件夹而是用/usr/local/简直无语，因为原先MacTex就已经装在里面了啊。现在弄得很乱。

3、提示中有Unexpected dylibs:
/usr/local/lib/libtcl8.6.dylib
/usr/local/lib/libtk8.6.dylib
具体和http://apple.stackexchange.com/questions/122558/making-homebrew-and-r-app-live-together-happily 这个问题一模一样。看来果然是安装R造成的。

请问各位有用R编程的同学解决过这个问题吗？

4、另外我用的python是anaconda的集成版本，不知道有没有人和我一样，看起来homebrew和anaconda玩得也不是很开心，不知道日后会不会有问题。我一般用conda/pip安装，应该不会起冲突吧。