Manhattan Plot

释义 Definition

Manhattan plot（曼哈顿图）：一种常用于全基因组关联分析（GWAS）的散点图。横轴通常表示基因组位置（按染色体排列），纵轴表示关联显著性（常用 \(-\log_{10}(p)\)）。显著位点会形成“高楼”般的尖峰，整体外观像曼哈顿天际线。

发音 Pronunciation (IPA)

/mænˈhætən plɑːt/（美式常见；plot 也可读 /plɒt/）

例句 Examples

A Manhattan plot shows which genetic variants are most significant.
曼哈顿图显示哪些遗传变异最显著。

In the GWAS results, several peaks in the Manhattan plot exceeded the genome-wide significance threshold, suggesting loci potentially associated with the trait.
在这次 GWAS 结果中，曼哈顿图里有多个峰值超过了全基因组显著性阈值，提示可能与该性状相关的基因座。

词源 Etymology

该术语源于图形外观：大量散点中夹杂少数“高峰”，看起来像纽约曼哈顿密集的摩天大楼天际线，因此得名。它在统计遗传学与生物信息学中逐渐成为展示 GWAS 显著性结果的标准图形之一。

相关词 Related Words

• Gwas
• Genome
• Locus
• Snp
• P-Value
• Significance
• Volcano Plot
• Qq Plot

文献与著作 Literary Works

• 《Genome-Wide Association Studies and Genomic Prediction》（C. Gondro 等编）：讨论 GWAS 可视化与常见图形（含曼哈顿图的使用场景）。
• 《Statistical Human Genetics: Methods and Protocols》（Methods in Molecular Biology 系列）：在 GWAS 结果呈现章节中常提及曼哈顿图与阈值线。
• Nature Genetics 等期刊的大量 GWAS 论文：常用曼哈顿图作为主图展示全基因组显著峰（例如多种复杂性状的关联研究论文中）。